- a -

• advance_and_find_timesteps() : timestep.c, proto.h
• allocate_commbuffers() : proto.h, allocate.c
• allocate_memory() : proto.h, allocate.c

- b -

• begrun() : proto.h, begrun.c
• blockpresent() : proto.h, io.c

- c -

• catch_abort() : proto.h
• catch_fatal() : proto.h
• check_omega() : proto.h, init.c
• close_outputfiles() : proto.h, begrun.c
• compare_key() : proto.h, peano.c
• compute_accelerations() : proto.h, accel.c
• compute_global_quantities_of_system() : proto.h, global.c
• compute_potential() : proto.h, potential.c

- d -

• dens_compare_key() : proto.h, density.c
• density() : proto.h, density.c
• density_decouple() : proto.h
• density_evaluate() : proto.h, density.c
• distribute_file() : read_ic.c, proto.h
• dmax() : system.c, proto.h
• dmin() : system.c, proto.h
• do_box_wrapping() : proto.h, predict.c
• domain_compare_key() : proto.h, domain.c
• domain_compare_toplist() : proto.h, domain.c
• domain_countToGo() : proto.h, domain.c
• domain_decompose() : proto.h, domain.c
• domain_Decomposition() : proto.h, domain.c
• domain_determineTopTree() : proto.h, domain.c
• domain_exchangeParticles() : proto.h, domain.c
• domain_findExchangeNumbers() : proto.h, domain.c
• domain_findExtent() : proto.h, domain.c
• domain_findSplit() : proto.h, domain.c
• domain_shiftSplit() : proto.h, domain.c
• domain_sumCost() : proto.h, domain.c
• domain_topsplit() : proto.h, domain.c
• domain_topsplit_local() : proto.h, domain.c
• domain_walktoptree() : domain.c
• drift_integ() : proto.h, driftfac.c
• dump_particles() : proto.h, forcetree.c

- e -

• empty_read_buffer() : read_ic.c, proto.h
• endrun() : proto.h, endrun.c
• energy_statistics() : run.c, proto.h
• every_timestep_stuff() : run.c, proto.h
• ewald_corr() : proto.h, forcetree.c
• ewald_force() : proto.h, forcetree.c
• ewald_init() : proto.h, forcetree.c
• ewald_pot_corr() : proto.h, forcetree.c
• ewald_psi() : proto.h, forcetree.c

- f -

• fill_Tab_IO_Labels() : proto.h, io.c
• fill_write_buffer() : proto.h, io.c
• find_dt_displacement_constraint() : timestep.c, proto.h
• find_files() : read_ic.c, proto.h
• find_next_outputtime() : run.c, proto.h
• find_next_sync_point_and_drift() : run.c, proto.h
• force_create_empty_nodes() : proto.h, forcetree.c
• force_exchange_pseudodata() : proto.h, forcetree.c
• force_flag_localnodes() : proto.h, forcetree.c
• force_insert_pseudo_particles() : proto.h, forcetree.c
• force_setupnonrecursive() : proto.h
• force_treeallocate() : proto.h, forcetree.c
• force_treebuild() : proto.h, forcetree.c
• force_treebuild_single() : proto.h, forcetree.c
• force_treeevaluate() : proto.h, forcetree.c
• force_treeevaluate_direct() : proto.h, forcetree.c
• force_treeevaluate_ewald_correction() : proto.h, forcetree.c
• force_treeevaluate_potential() : proto.h, forcetree.c
• force_treeevaluate_potential_shortrange() : proto.h, forcetree.c
• force_treeevaluate_shortrange() : proto.h, forcetree.c
• force_treefree() : proto.h, forcetree.c
• force_treeupdate_pseudos() : proto.h, forcetree.c
• force_update_hmax() : proto.h, forcetree.c
• force_update_len() : proto.h, forcetree.c
• force_update_node() : proto.h
• force_update_node_hmax_local() : proto.h, forcetree.c
• force_update_node_hmax_toptree() : proto.h, forcetree.c
• force_update_node_len_local() : proto.h, forcetree.c
• force_update_node_len_toptree() : proto.h, forcetree.c
• force_update_node_recursive() : proto.h, forcetree.c
• force_update_pseudoparticles() : proto.h, forcetree.c
• force_update_size_of_parent_node() : proto.h
• free_memory() : proto.h, allocate.c

- g -

• get_bytes_per_blockelement() : proto.h, io.c
• get_dataset_name() : proto.h, io.c
• get_datatype_in_block() : proto.h, io.c
• get_drift_factor() : proto.h, driftfac.c
• get_gravkick_factor() : proto.h, driftfac.c
• get_hydrokick_factor() : proto.h, driftfac.c
• get_particles_in_block() : proto.h, io.c
• get_random_number() : system.c, proto.h
• get_timestep() : timestep.c, proto.h
• get_values_per_blockelement() : proto.h, io.c
• grav_tree_compare_key() : proto.h, gravtree.c
• gravity_forcetest() : proto.h, gravtree_forcetest.c
• gravity_tree() : proto.h, gravtree.c
• gravity_tree_shortrange() : proto.h
• gravkick_integ() : proto.h, driftfac.c
• growthfactor_integ() : driftfac.c

- h -

• hydro_compare_key() : proto.h, hydra.c
• hydro_evaluate() : proto.h, hydra.c
• hydro_force() : proto.h, hydra.c
• hydrokick_integ() : proto.h, driftfac.c

- i -

• imax() : system.c, proto.h
• imin() : system.c, proto.h
• init() : proto.h, init.c
• init_drift_table() : proto.h, driftfac.c
• init_peano_map() : proto.h

- l -

• long_range_force() : proto.h, longrange.c
• long_range_init() : proto.h, longrange.c
• long_range_init_regionsize() : proto.h, longrange.c

- m -

• main() : main.c
• move_particles() : proto.h, predict.c
• my_fread() : proto.h, io.c
• my_fwrite() : proto.h, io.c

- n -

• ngb_clear_buf() : proto.h, ngb.c
• ngb_treeallocate() : proto.h, ngb.c
• ngb_treebuild() : proto.h, ngb.c
• ngb_treefind_pairs() : proto.h, ngb.c
• ngb_treefind_variable() : proto.h, ngb.c
• ngb_treefree() : proto.h, ngb.c
• ngb_treesearch() : proto.h
• ngb_treesearch_pairs() : proto.h
• ngb_update_nodes() : proto.h

- o -

• open_outputfiles() : proto.h, begrun.c

- p -

• peano_hilbert_key() : proto.h, peano.c
• peano_hilbert_key_inverse() : peano.c
• peano_hilbert_order() : proto.h, peano.c
• pm_init_nonperiodic() : proto.h
• pm_init_nonperiodic_allocate() : proto.h
• pm_init_nonperiodic_free() : proto.h
• pm_init_periodic() : proto.h, pm_periodic.c
• pm_init_periodic_allocate() : proto.h, pm_periodic.c
• pm_init_periodic_free() : proto.h, pm_periodic.c
• pm_init_regionsize() : proto.h
• pm_setup_nonperiodic_kernel() : proto.h
• pmforce_nonperiodic() : proto.h
• pmforce_periodic() : proto.h, pm_periodic.c
• pmpotential_nonperiodic() : proto.h
• pmpotential_periodic() : proto.h, pm_periodic.c
• pow() : proto.h

- r -

• read_file() : read_ic.c, proto.h
• read_header_attributes_in_hdf5() : read_ic.c, proto.h
• read_ic() : read_ic.c, proto.h
• read_outputlist() : proto.h, begrun.c
• read_parameter_file() : proto.h, begrun.c
• readjust_timebase() : proto.h, begrun.c
• reorder_gas() : proto.h, peano.c
• reorder_particles() : proto.h, peano.c
• restart() : restart.c, proto.h
• run() : run.c, proto.h

- s -

• savepositions() : proto.h, io.c
• second() : system.c, proto.h
• seed_glass() : proto.h
• set_random_numbers() : system.c, proto.h
• set_softenings() : proto.h, gravtree.c
• set_units() : proto.h, begrun.c
• setup_smoothinglengths() : proto.h, init.c
• statistics() : proto.h

- t -

• terminate_processes() : proto.h
• timediff() : system.c, proto.h

- w -

• write_file() : proto.h, io.c
• write_header_attributes_in_hdf5() : proto.h, io.c
• write_pid_file() : proto.h

---